深圳市第三人民医院（南方科技大学第二附属医院）原名深圳东湖医院，始建于1985年位于位于罗湖区布心路2019号，2012年搬至龙岗区布澜路并更名为深圳市第三人民医院。医院主要承担深圳市及周边港、澳、珠海、东莞、惠州地区的传染病与重大疫情的防控以及深圳市2000万市民的综合医疗服务，积极响应深圳市政府“东进战略”要求，以结核病为龙头，感染性疾病为强专科的大型三甲综合研究型医院，同时围绕 “一箭两翼、三支柱八支撑”建设方针，以国家结核病临床医学研究中心为核心，以感染病国家临床重点专科与器官移植中心建设两翼，以肝病、艾滋病、新发传染病及疑难感染病为支柱，全力建设八个综合专科为支撑，打造深圳市医疗高地。
2003年感染病科被评为广东省传染病特色专科；2005年肝病专业、艾滋病专业、结核病专业同时成为国家临床药物试验基地；2006年医院成为中国中西医结合学会传染病专业委员会的主任委员单位；2011年肝病、结核病和新发传染病同时获得深圳市临床重点专科；2011、2012年又分别获得广东省新发传染病诊治重点实验室与广东省中医传染病诊疗技术实验室。2013年感染科获得国家感染病临床重点专科、广东省感染性疾病临床重点专科，2018年医院获广东省高水平医院，并获得国家结核病临床医学研究中心（深圳唯一）。
医院门诊部开设了内科（消化内科、内分泌内科、心血管内科、肾内科、血液内科、呼吸内科和综合内科等）、外科（骨外科、普外科、泌尿外科、胸外科和神经外科等）、妇产科、儿科、五官科、皮肤性病科、康复科、中医科、介入治疗科以及急诊科、体检中心、肝病门诊、肺病门诊和感染病专科门诊等。住院部设有内科、外科、儿科、妇产科、眼科、耳鼻喉科、综合ICU、血液透析室、肝病科、肺病科、感染病住院部。
深圳市第三人民医院现有员工1500人，其中高级职称282人，博士后13人，博、硕士333人。享受国务院特殊津贴专家2人，享受深圳市特殊津贴专家2人，省市学科带头人18人。现有博士研究生导师5人，硕士研究生导师30人。
此外深圳市第三人民医院引进了包括中国科学院微生物所高福院士团队、浙江大学附属第一医院肝胆外科郑树森院士团队、生物芯片北京国家工程研究中心博奥生物集团程京院士团队、浙江大学附属第一医院感染科李兰娟院士团队、解放军302医院王福生院士团队、中国医学科学院病原生物学研究所金奇教授团队、香港大学艾滋病研究中心陈志伟教授团队、中山大学附属第一医院何晓顺教授团队、解放军总医院刘又宁教授团队、中山大学肿瘤医院张福君教授团队、东南大学附属中大医院邱海波教授、南京医科大学附属无锡人民医院陈静瑜教授等12个院士、国家级重点学科团队。
医院占地面积10万平方米，建筑面积15.2万平方米，编制病床778张，实际开放床位800余张，是目前国内医院中设计较先进、设备配置较高的医院之一。现有建筑单体14栋，以“院中院”布局，综合科、肝病、感染病、肺科均有独立的住院楼及门诊挂号、收费、化验检查系统。
医院设有深圳市肝病研究所，配套实验室面积4682㎡，建设有BSL-3实验室和SPF级动物室，其中生物安全二级实验室面积3900㎡，BSL-3实验室391㎡，动物实验室391㎡，为全市医院所独有。购置的科研设备总价值超过5600万元。包括illumina事代高通量测序仪、Sequenom Massarray生物芯片质谱系统、Zeiss共聚焦显微镜、高效液相色普仪、超速离心机、磁珠细胞分选器、激光显微切割仪等。建立完善了高通量MassARRAY核酸分析平台、细胞免疫分析技术平台、分子生物学技术平台、实验动物技术平台
深圳市第三人民医院在近5年（至2018年）来医院先后承担国家重大科技专项24项，国家、省自然科学基金33项，累计获得科研经费超过3亿元。2012年感染病科引进的香港大学“新发传染病研究团队”获深圳市“孔雀计划”资助（2500万元）。2015年获得深圳市卫生系统首个国家自然科学基金杰出青年基金。先后获得国家“十二五”传染病重大科技专项分课题18项，国家“十二五”传染病重大科技专项牵头1项。近3年共发表论文统计源论文380余篇，其中SCI论文176篇，累计影响因子近928分，包括国际顶尖杂志《N Engl J Med.》、《Science》、《Nature》、《Lancet》、《Nat Genent》、《PLoSPathog》等论文10余篇。国家、省、市级奖项9项，获得发明专利9项。
2018年，医院在自然出版集团以指数方式发布的 “中国医院自然指数”排名全国第87位；在中国医学科学院发布的26个专科科技影响力排名中，结核病学排名全国第6位，传染病学排名全国第21位。
1985年，医院开业，原名深圳市东湖医院，位于罗湖区布心路2019号。
1996年，创建深圳市肝病研究所。
2000年，医院改扩建工程得以立项并实施。
2002年，新住院大楼开始动工，2004年5月住院大楼正式启用。
2003年SARS疫情中，被指定为深圳唯一收治SARS的定点医院，无一例医务人员被感染SARS，无一例SARS病人院内死亡。
2004年元月，深圳市政府批准医院更名为“深圳市第三人民医院”，并立项迁址（龙岗区布澜路）新建深圳市第三人民医院。
2006年，创建药物临床基地，为深圳市最早的国家级药物临床基地。
2006年，三院建设项目正式破土动工。
2010年，三院建设项目竣工开业。
2012年12月26日，原东湖医院整体搬迁，新医院全面启用。
2006年，通过创新治疗方法治愈深圳首例人禽流感患者。
2008年全球甲流大爆发，全院收治了来自全球五大洲66个国家和地区的1166例甲流隔离观察患者。
2013年，共收治重症人感染H7N9禽流感患者37例，仅4例死亡，病死率10.8%，远低于全国病死率（38.6%）。
2017年5月，深圳市第三人民医院正式获得广东省卫计委颁发的肝脏移植、肾脏移植“牌照”。
2018年2月26日，深圳市第三人民医院、中国科学院病原微生物与免疫学重点实验室、华大基因、中兴网信-巴西FIOCRUZ基金会建立传染病预防与研究中心。 2019年2月，深圳市第三人民医院、广东省防痨协会和广东省预防医学会共同主办了“粤港澳大湾区传染病防控合作发展研讨会”，并联合香港大学新发传染性疾病国家重点实验室、澳门大学健康科学学院签订协议，共同成立“粤港澳大湾区新发重大传染病应急防治医学研究中心”。
322路，398路，977路，K359路，M224路，M273路，M300路，M301路，M311路，M324路，M356路，M363路，M404路，B695路，m402路至第三人民医院。
（医院数据更新截止2019年5月，具体官方为准）
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