华润三九主要从事医药产品的研发、生产、销售及相关健康服务，主营核心业务定位于OTC和中药处方药。

OTC核心产品在感冒、胃肠、皮肤和骨科用药市场占据了较高的市场份额。公司成功打造了999全系列家庭用药品牌，三九胃泰系列、999感冒灵系列、999皮炎平等系列产品在国内药品市场上具有较高的知名度。

与此同时，华润三九在中药注射剂行业享有较高声誉，拥有参附注射液、参麦注射液、华蟾素等10多个中药注射剂品种。【 】

1999年，由三九集团、三九药业股份有限公司等5家公司发起设立股份制公司。2000年3月9日在深圳证券交易所挂牌上市。公司于2007年11月底正式进入华润集团。

2010年2月，公司名称由"三九医药股份有限公司"正式变更为"华润三九医药股份有限公司"。