关于肠粉的起源，众说纷纭，没有统一的说法，有人说最早是抗日战争时期由泮塘荷仙馆创制。又有人说肠粉起源于广东，早在清代末期，广州街头上就已经听到卖肠粉的叫卖声。

比较广为流传的一种说法：据说其起源于唐朝的泷州（今广东罗定市），由当地的一种传统美食油味糍演变而成。当地人称之为“龙龛糍”。肠粉之名大有来头。乾隆年间，乾隆皇帝游江南，听了吃货大臣纪晓岚的美言，专门拐到罗定吃龙龛糍。当吃到这种“爽、嫩、滑”的龙龛糍时，乾隆赞不绝口，并乘兴说：“这糍并不算是糍粑，反而有点像猪肠子，不如就叫肠粉吧”。肠粉因而得名，并在广东传开。