国家级一流本科专业建设点、国家特色专业建设点

临床医学（八年制）专业创办于1917年，是国家级一流本科专业建设点、国家特色专业建设点。学制8年，每年招生总数不超过90人。前2.5年为医学预科阶段，在清华大学学习普通自然科学、社会科学和人文科学课程。后5.5年为医学本科阶段，在协和本部学习基础医学和临床医学课程，完成临床实习、科研训练和毕业论文。学生毕业时成绩优秀、符合学位授予规定者可获得医学博士学位。其特色是实行“八年一贯制，本硕博融通，加强基础，注重技能，强调素质，整体优化，面向临床、科研”。

国家特色专业建设点、北京市一流本科专业

护理学专业本科创办于1920年，是北京协和医学院最好的专业之一，是北京市一流本科专业，入选国家特色专业建设点。学制4年，每年招生总数为150人，学生毕业时符合学位授予规定者授予理学学士学位。大多数毕业生成为护理行业的领导及骨干，为推动中国护理事业的建设和发展发挥了重要作用。至今已有7名毕业生获得国际护理学界最高荣誉“南丁格尔奖”，为我国护理院校之首冠。